Le bonus de comabat de raid est une fonctionnalité disponible pour les dresseurs qui ont réussi à vaincre Boss de Raid  et donne l'opportunité d'attraper le Pokémon (le boss de raid) comme s'il s'agissait d'un Pokémon dans la nature, mais avec une différence significative : le dresseur ne peut pas utiliser ses propres Poké Balls. Après avoir vaincu avec succès le Boss de Raid et avoir été récompensé par des objets, un résumé des performances de combat de raid est affiché au dresseur avec le nombre de Honor Ball qui leur a été remise et le bouton Aller au défi bonus s'affiche.

Résumé de l'héritage de Raid Battle avec le bonus de contribution de l'équipe Initialement, le bonus de contribution d'équipe récompensait des balles Premier supplémentaires, mais il a été modifié avec l'introduction de Mega Raids et il est maintenant remplacé par le bonus de vitesse qui correspond au moment où le Raid Boss a été vaincu. Dans les raids de niveau 1, 3 et 5, le bonus de vitesse récompense le formateur avec des balles Premier supplémentaires, tandis que dans les batailles de méga raid, une méga énergie est donnée en fonction du bonus de vitesse.

Écran de capture du défi bonus Après avoir appuyé sur le bouton Bonus Challenge, l'écran de rencontre apparaît avec un Pokémon qui est un Raid Boss vaincu. Le joueur n'a pas les Poké Balls qu'il possède actuellement à utiliser, mais seulement les Ultra Balls dont il a été récompensé pour ses performances lors d'une bataille de raid gagnée. Les Pokémon du Défi bonus, en particulier les Pokémon légendaires et mythiques, ont tendance à esquiver et à attaquer plus fréquemment et ont un faible taux de capture. Cependant, plus la tentative de capture est longue (c'est-à-dire qu'il reste moins de balles Premier), plus les chances de capture sont élevées (bien que le montant exact soit toujours en cours de recherche, il semble qu'à partir de la 9e balle utilisée, cela équivaut à utiliser une Ultra Ball) .

Si le Dresseur ne parvient pas à capturer le Pokémon avec sa dernière Premier Ball et qu'il ne reste plus de Premier Ball, le Pokémon s'enfuira. L'entraîneur peut quitter l'écran de rencontre de Bonus Challenge et y entrer à nouveau en appuyant sur le même gymnase où le Raid Boss a été vaincu, mais tant que le raid se déroule toujours sur cette arène. Dresseur peut capturer des Pokémon après avoir vaincu Boss de raid  dans le combat de raid qui s'est terminée et n'est plus visible sur l'arène, mais une fois qu'ils ont quitté l'écran de rencontre, ils ne peuvent pas y revenir